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A UNIFESP atua em todas as áreas do conhecimento, realizando com excelência atividades de ensino, pesquisa e extensão nos seis campi implantados: São Paulo (Escola Paulista de Medicina e Escola Paulista de Enfermagem), Baixada Santista (Instituto Saúde e Sociedade e Instituto do Mar), Guarulhos (Escola de Filosofia, Letras e Ciências Humanas), Diadema (Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas), São José dos Campos (Instituto de Ciência e Tecnologia) e Osasco (Escola Paulista de Política, Economia e Negócios). O Campus Zona Leste, que abrigará o Instituto das Cidades, encontra-se em fase de implantação. O Hospital São Paulo vincula-se à instituição como Hospital Universitário 1, enquanto o Hospital Universitário 2, cujas obras foram concluídas, funcionará como hospital-dia, agregando ambulatórios de especialidades, centro cirúrgico de baixa e média complexidade e centro diagnóstico. A Unifesp possui atualmente cerca de 13.000 estudantes de graduação, 5.300 estudantes de pós-graduação, mais de 1.100 residentes médicos e 575 residentes multiprofissionais, em 52 cursos de graduação e em 68 cursos de pós-graduação. A instituição destaca-se nos rankings nacionais e internacionais como uma das principais universidades brasileiras. No ranking do Times Higher Education de 2018, é a primeira universidade federal brasileira e a quarta na América Latina.